Doanh nghiệp không cần nộp báo cáo tồn kho có xác nhận của cơ quan kiểm toán độc lập khi thuộc diện kiểm tra trước, hoàn thuế sau. Trong trường hợp có nghi vấn, Hải quan sẽ tiến hành kiểm tra trực tiếp sổ sách tại doanh nghiệp
Công văn số 1865 ngày 23/07/2009 của Hải quan Đồng Nai, doanh nghiệp nội địa thuê DNCX gia công sẽ được miễn thuế nhập khẩu đối với sản phẩm sau gia công nếu các doanh nghiệp này mở tờ khai xuất khẩu là nguyên phụ liệu và nhập khẩu là sản phẩm thành phẩm.
Công văn số 3013 ngày 22/07/2009 của TCT, doanh nghiệp chuyển đổi có thể được hạch toán vào chi phí đối với các hóa đơn kể trên nếu đã được cơ quan Thuế kiểm tra và tự chứng minh được thực tế chỉ sử dụng cho mục đích sản xuất, kinh doanh.
Công văn số 2998 ngày 22/07/2009 của TCT, doanh nghiệp chỉ phải đăng ký khi sử dụng chứng từ in từ thiết bị thu phí trông giữ xe đáp ứng quy định tại điểm 7, mục I phần B và mẫu hoá đơn bán lẻ ban hành kèm theo Thông tư số 120 ngày 30/12/2002 của BTC
Công văn số 3022 ngày 22/07/2009 của TCT, trong trường hợp nộp hồ sơ đề nghị gia hạn muộn, các doanh nghiệp này vẫn được giãn thời hạn nộp thuế nếu đã nộp hồ sơ khai thuế đúng hạn và đã gửi hồ sơ gia hạn tới cơ quan thuế trước thời điểm công bố quyết định thanh tra, kiểm tra thuế tại trụ sở doanh nghiệp.
Công văn số 2997 ngày 22/07/2009 của TCT, hoạt động tư vấn giám sát, tư vấn quản lý dự án, tư vấn lập dự án đầu tư, tư vấn lập khảo sát thiết kế các công trình thuỷ lợi, giao thông, xây dựng dân dụng không thuộc lĩnh vực khuyến khích đầu tư là “Tư vấn pháp luật, đầu tư, kinh doanh, quản trị doanh nghiệp, dịch vụ tư vấn về khoa học và công nghệ, bảo vệ quyền sở hữu trí tuệ và chuyển giao công nghệ”
Công văn số 2999 ngày 22/07/2009 của TCT, thuế suất thuế GTGT đối với mặt hàng đĩa CD, VCD, DVD (không thuộc điểm 15, mục II, Phần A Thông tư số 129 ngày 26/12/2008 của BTC)
Công văn số 3015 ngày 22/07/2009 của TCT, doanh nghiệp không được khấu trừ hoặc hoàn thuế GTGT đối với các hóa đơn GTGT đầu vào liên quan đến việc giải phóng mặt bằng và tái định cư nêu trên.
Công văn số 2975 ngày 21/07/2009 của TCT, doanh nghiệp đã kê khai khấu trừ thuế GTGT đầu vào của hàng nhập khẩu theo Tờ khai hải quan nhưng không kê khai theo chứng từ nộp thuế GTGT có thể được phép kê khai khấu trừ, hoàn thuế GTGT đối với số hàng này nếu doanh nghiệp đã nộp đủ số thuế GTGT trước khi cơ quan thuế kiểm tra trước hoàn thuế
Công văn số 110 ngày 20/7/2009 hướng dẫn quy trình kiểm tra nhà nước về chất lượng và chứng nhận hợp quy đối với hàng hóa nhập khẩu thuộc Danh mục sản phẩm, hàng hóa như xăng, nhiên liệu điêzen, mũ bảo hiểm cho người đi mô tô xe máy, sản phẩm điện, điện tử,
