Theo Công văn số 4871 ngày 14/08/2009 của TCHQ, từ ngày 15/08/2009, việc lấy mẫu đối với hàng hóa nhập khẩu chuyển cửa khẩu thuộc diện được miễn kiểm tra thực tế hàng hóa do Chi cục Hải quan cửa khẩu nhập thực hiện.
TCT đã ban hành Công văn số 3320 ngày 13/8/2009 giải đáp một số vướng mắc về thuế TNCN. Theo đó, thu nhập từ việc nhận thừa kế vốn góp trong các doanh nghiệp thuộc diện chịu thuế TNCN.
Từ ngày 27/09/2009, một số hàng hoá XNK chỉ cần khai báo trị giá trên tờ khai hàng hoá xuất khẩu hoặc nhập khẩu mà không phải khai báo trên tờ khai trị giá tính thuế.
Theo Công văn số 4781 ngày 12/08/2009 của TCHQ, bản hợp đồng qua fax đã được khẳng định là có giá trị pháp lý tương đương với hợp đồng bằng văn bản.
Theo Công văn số 4752 ngày 11/08/2009 của TCHQ, bộ phận trao đổi nhiệt dạng tấm thuộc nhóm 8419 (mã HS 841950.90.00), hoạt động không bằng điện có mã số là 841950.90.00 và thuế suất thuế nhập khẩu ưu đãi là 3%.
Thuế suất thuế GTGT áp dụng đối với các khoản thu từ nghiệp vụ cho thuê tài chính (phí trả nợ trước hạn, phí hồ sơ, phí quản lý khoản thuê đối với tài sản cho thuê, phí đầu mối, phí quản lý vốn nhận uỷ thác cho thuê tài chính) là 10%.
Trừ hàng hóa được quy định tại Điều 4.2 và Điều 4.3 Hiệp định quá cảnh hàng hoá giữa Việt Nam và Lào đã ký ngày 13/3/2009 bắt buộc có giấy phép quá cảnh, các hàng hóa khác chỉ cần làm thủ tục cho hàng hoá quá cảnh tại hải quan cửa khẩu.
Doanh nghiệp có thể được xem xét gia hạn nộp thuế nếu bị thiệt hại vật chất, gây ảnh hưởng trực tiếp đến sản xuất, kinh doanh do thiên tai, hỏa hoạn, tai nạn bất ngờ hoặc không có khả năng nộp thuế đúng hạn do gặp khó khăn đặc biệt theo quy định của Chính phủ.
Đơn vị hạch toán phụ thuộc có hạch toán kế toán khi xuất hàng (kể cả cho trụ sở chính) phải sử dụng hoá đơn GTGT để thanh toán, kê khai và nộp thuế GTGT tại địa phương nơi sản xuất, kinh doanh. Được biết, các hoá đơn GTGT này sẽ là căn cứ để đơn vị kê khai thuế GTGT đầu ra, đầu vào.
Công văn số 4468 ngày 28/07/2009, TCHQ một lần nữa đã xác nhận chỉ các dự án thuộc lĩnh vực và địa bàn ưu đãi đầu tư theo quy định tại Phụ lục I và II của Nghị định số 108 ngày 22/9/2006 của Chính phủ mới được hưởng ưu đãi miễn thuế nhập khẩu tạo TSCĐ theo quy định của Nghị định số 149 ngày 08/12/2005 của Chính phủ.