Đối với hàng xuất khẩu theo giá FOB, số thuế GTGT không được khấu trừ tương ứng với giá trị hàng hóa tổn thất và giá trị hàng hóa tổn thất sẽ không được tính vào chi phí hợp lý.
Doanh nghiệp chỉ được hưởng ưu đãi theo diện đầu tư mở rộng đối với dự án đầu tư mở rộng sản xuất mà đến ngày 31/12/2008 đang đầu tư xây dựng dở dang và đi vào sản xuất trong năm 2009.
Doanh nghiệp mua lại phần vốn góp điều lệ của thành viên công ty không phải nộp thuế. Trong trường hợp này, thành viên công ty bán lại toàn bộ phần vốn góp nêu trên mà có lãi thì phải kê khai, nộp thuế thu nhập cá nhân theo quy định pháp luật.
Trường hợp doanh nghiệp đang làm thủ tục giải thể, sau khi nộp báo cáo quyết toán thuế nhưng doanh nghiệp chưa được cơ quan thuế kiểm tra và xác nhận báo cáo quyết toán, doanh nghiệp vẫn có thể phát sinh thu chi nhưng phải nộp báo cáo quyết toán bổ sung.
Các doanh nghiệp có thể tính khấu hao tài sản ngay kể cả khi tài sản phải ngừng hoạt động để sửa chữa. Tuy nhiên, việc tính khấu hao đối với tài sản tạm dừng để sửa chữa chỉ áp dụng cho trường hợp tạm dừng dưới 12 tháng.
Các mặt hàng sữa bột dành cho trẻ em dưới 6 tuổi, than, sách giáo khoa, giấy in, giấy in báo, giấy viết phải đăng ký giá trước khi bán sản phẩm ra thị trường lần đầu, trước khi điều chỉnh giá hoặc khi cơ quan nhà nước có thẩm quyền yêu cầu.
Khi phát sinh thuế xuất khẩu cho nguyên liệu cung ứng cho hợp đồng gia công, doanh nghiệp phải hạch toán giảm doanh thu, đồng thời xác định giá tính thuế GTGT không bao gồm thuế xuất khẩu.
Theo Công văn số 1315 ngày 11/8/2010 của Cục Hải quan Đồng Nai, doanh nghiệp được phép nhập khẩu loại máy này dưới hình thức thuê để làm phương tiện trực tiếp sản xuất.
Doanh nghiệp không được khấu trừ, hoàn thuế giá trị gia tăng đối với hàng hóa xuất khẩu bị hư hỏng, không được khách hàng thanh toán.
Doanh thu của chi nhánh từ việc bán sản phẩm do doanh nghiệp sản xuất được hưởng ưu đãi về thuế suất thuế thu nhập doanh nghiệp như đối với doanh nghiệp.