Tổng cục Thuế đã chỉ rõ nghĩa vụ phải lập hóa đơn và phải kê khai, tính thuế giá trị gia tăng đầu ra đối với hàng hóa do doanh nghiệp tự sản xuất được sử dụng để phục vụ cho hoạt động sản xuất kinh doanh.
Hóa đơn hợp lệ phải có nội dung ghi trên các liên hóa đơn cùng số giống nhau. Trong trường hợp có sự sai lệch nội dung giữa các liên của hóa đơn, doanh nghiệp sẽ không được khấu trừ, hoàn thuế và bị xử phạt vi phạm về sử dụng hóa đơn theo quy định.
Doanh nghiệp không được tùy ý hủy và lập lại hóa đơn theo yêu cầu của khách hàng khi các nội dung trên hóa đơn đã được ghi đầy đủ và phù hợp. Chỉ trong trường hợp có sai sót về nội dung chỉ tiêu trên hóa đơn, doanh nghiệp mới được hủy và lập lại hóa đơn.
Doanh nghiệp sẽ không được hưởng ưu đãi thuế thu nhập doanh nghiệp theo diện mới thành lập từ dự án đầu tư nếu thực tế đã thành lập nhiều năm trước khi triển khai dự án sản xuất sản phẩm mới.
Số lỗ của chi nhánh phát sinh trước khi sáp nhập vào doanh nghiệp sẽ được chuyển vào thu nhập chịu thuế của doanh nghiệp liên tục không quá 5 năm, kể từ năm tiếp sau năm phát sinh lỗ.
Khi thay đổi tên, doanh nghiệp sẽ phải kê khai thay đổi thông tin đăng ký thuế để được cấp giấy chứng nhận đăng ký thuế mới với mã số thuế cũ.
Doanh nghiệp tạm thời chưa khấu trừ 10% thuế thu nhập cá nhân đối với người lao động có cam kết ước tính tổng thu nhập chưa đến mức phải nộp thuế.
Doanh nghiệp sẽ được hạch toán vào chi phí tiền lương khoản chi khoán tiền công tác phí đã thực chi và đã thỏa thuận trong hợp đồng hoặc thỏa ước lao động theo mức khống chế do Bộ Tài chính quy định.
Doanh nghiệp nhà nước được giao đất không thu tiền sử dụng đất để sản xuất lâm nghiệp trước ngày 01/01/1999 sẽ phải chuyển sang thuê đất hoặc giao đất có thu tiền sử dụng đất.
Hóa đơn thương mại lập trên cơ sở thỏa thuận giữa bên mua và bên bán trong bộ chứng từ xuất khẩu không thay thế được hóa đơn giá trị gia tăng.