Tại công văn số 14389/BTC-TCT của Bộ tài chính ngày 12 tháng 10 năm 2009 trả lời Công văn ngày 28/7/2009 của Hội Doanh nghiệp vừa và nhỏ Nghệ An kiến nghị về cách xác định giá tính thuế tài nguyên đối với tài nguyên xuất khẩu, Bộ Tài chính có ý kiến như sau:
- Tại khoản 4, Điều 6 Nghị định số số 05/2009/NĐ-CP ngày 19/01/2009 của Chính phủ quy định: "4. Bộ Tài chính hướng dẫn việc xác định giá tính thuế tài nguyên quy định tại Điều này."
- Tại điểm 1.1, khoản 1, Điều 6 Thông tư số 124/2009/TT-BTC ngày 17/6/2009 của Bộ Tài chính hướng dẫn thi hành Nghị định số 05/2009/NĐ-CP ngày 19/01/2009 của Chính phủ quy định chi tiết thi hành Pháp lệnh thuế tài nguyên và Pháp lệnh sửa đổi, bổ sung một số Điều của Pháp lệnh thuế tài nguyên, quy định: "Trường hợp tài nguyên khai thác không tiêu thụ trong nước mà dùng xuất khẩu toàn bộ thì giá tính thuế tài nguyên là giá xuất khẩu (FOB), không bao gồm thuế xuất khẩu."
Căn cứ quy định nêu trên, Bộ Tài chính quy định cách xác định giá tính thuế tài nguyên xuất khẩu là giá xuất khẩu (FOB), trừ thuế xuất khẩu. Mức chi phí thuế xuất khẩu được trừ khỏi giá tài nguyên xuất khẩu theo quy định tại Quyết định số 35/2008/QĐ-BTC ngày 06/6/2008 của Bộ Tài chính về việc sửa đổi mức thuế suất thuế xuất khẩu đối với một số mặt hàng trong Biểu thuế xuất khẩu.