Bộ Tài chính cho biết, thời gian qua Bộ nhận được phản ánh về vướng mắc của Cục Thuế các địa phương xung quanh việc hoàn thuế trong trường hợp sử dụng hóa đơn GTGT đối với hàng hóa, dịch vụ XK ra nước ngoài. Để thống nhất xử lý tại cơ quan Thuế và DN, Bộ Tài chính đã có văn bản số 6421/BTC-TCT hướng dẫn thực hiện
Theo Bộ Tài chính, trường hợp DN XK hàng hóa, dịch vụ nhưng chưa nắm bắt kịp thời thay đổi tại Thông tư 153/2010/TT- BTC hướng dẫn thi hành Nghị định số 51/2010/NĐ-CP ngày 14 -5- 2010 của Chính phủ quy định về hoá đơn bán hàng hóa, cung ứng dịch vụ nên vẫn xuất hóa đơn GTGT thay vì phải xuất hóa đơn XK, được xử lý theo hướng: Nếu cơ quan Thuế chưa công bố quyết định thanh tra, kiểm tra thuế tại DN thì DN thực hiện hủy hóa đơn GTGT đã xuất, đồng thời lập lại hóa đơn XK và thực hiện kê khai điều chỉnh bổ sung theo quy định.
Nếu cơ quan Thuế đã công bố quyết định thanh tra, kiểm tra thuế tại DN thì đề nghị Cục Thuế kiểm tra cụ thể, nếu thực tế hàng hóa dịch vụ của DN đã thực XK, hồ sơ của DN đáp ứng được đầy đủ các điều kiện khấu trừ, hoàn thuế đầu vào đối với hàng XK theo quy định; riêng hóa đơn DN vẫn xuất hóa đơn GTGT thay vì phải xuất hóa đơn XK, hóa đơn vẫn còn lưu tại quyển.
Đồng thời tại kỳ hoàn thuế DN đã thực hiện hạch toán kế toán doanh thu chi phí của hàng XK trong sổ kế toán có hóa đơn bán hàng XK, tờ khai hải quan, Invoice, chứng từ thanh toán qua ngân hàng theo quy định thì xem xét để DN kê khai, khấu trừ, hoàn thuế GTGT đầu vào tương ứng với lô hàng XK.
Bộ Tài chính yêu cầu cơ quan Thuế địa phương thực hiện việc hướng dẫn, tuyên truyền hỗ trợ DN thực hiện xuất hóa đơn theo đúng quy định này.