Được triển khai thí điểm năm 2009, tính đến thời điểm hiện nay, chương trình khai thuế điện tử đã được mở rộng tới các tỉnh, thành phố trong cả nước, với số lượng DN đăng ký tham gia tăng dần theo từng năm. Năm 2009 có 1.500 DN, năm 2010 có 9.000 DN, năm 2011 có 80.000 DN, năm 2012 gần 200.000 DN đăng ký dịch vụ khai thuế điện tử.
Theo Báo cáo của Tổng cục Thuế, đến tháng 6-2013, ngành Thuế đã thực hiện mở rộng kê khai thuế qua mạng Internet tại 50 tỉnh, thành phố với 265.114 doanh nghiệp (DN); trong đó riêng khối DN lớn, đã có 91% số DN thực hiện kê khai thuế điện tử.
Theo nhận định của Tổng cục Thuế, việc kê khai thuế qua mạng là xu hướng phát triển tất yếu của công cuộc cải cách, hiện đại hóa ngành Thuế. Về phía các DN cũng được lợi rất nhiều từ việc kê khai thuế qua mạng như: Không giới hạn số lần gửi tờ khai; khi kê khai sai mà vẫn còn hạn nộp tờ khai, DN có thể gửi tờ khai thay thế với số lần gửi thay thế không hạn chế trước 24 giờ ngày cuối cùng nộp tờ khai vẫn không bị tính nộp chậm; có thể khai thuế ở bất cứ đâu và gửi tờ khai vào tất cả các ngày kể cả ngày Lễ, Tết, thứ Bảy, Chủ nhật.
Mặt khác, cơ quan Thuế sẽ giảm nguồn lực, cơ sở vật chất, chi phí trong việc tiếp nhận, xử lý, lưu trữ và thuận lợi trong việc kiểm tra, đối chiếu nghĩa vụ và hoàn thuế cho người nộp thuế; hạn chế tiêu cực khi phải làm việc trực tiếp với DN.
Theo Tổng cục trưởng Tổng cục Thuế Bùi Văn Nam, kể từ ngày 1-7-2013 khi Luật sửa đổi, bổ sung một số điều của Luật Quản lý thuế có hiệu lực thi hành, đã bổ sung nghĩa vụ của người nộp thuế trong việc ứng dụng công nghệ thông tin để nâng cao quản trị doanh nghiệp cũng như phát triển phương thức quản lý thuế điện tử như: Trường hợp người nộp thuế là tổ chức kinh doanh tại địa bàn có cơ sở hạ tầng về công nghệ thông tin phải thực hiện kê khai, nộp thuế, giao dịch với cơ quan quản lý thuế thông qua phương tiện điện tử theo quy định của pháp luật về giao dịch điện tử. Đây cũng được coi là đột phá nhằm tiếp tục thực hiện mục tiêu cải cách, hiện đại hóa và hội nhập của ngành Thuế.
Do vậy, nhiệm vụ đặt ra trong năm 2013 sẽ đạt 100% DN lớn thực hiện khai thuế điện tử, nâng tổng số DN khai thuế điện tử trong cả nước đạt 280.000 DN, trong thời gian tới, ngành Thuế sẽ thực hiện các giải pháp hỗ trợ người nộp thuế thông qua điện thoại, email, trực tiếp. Công khai các thông tin về địa chỉ hỗ trợ cho người nộp thuế; Tổ chức các hội nghị tập huấn cho CBCC thuế và người nộp thuế…
Bên cạnh đó, Tổng cục Thuế tiếp tục hoàn thiện hệ thống, nâng cấp hạ tầng mạng, đường truyền thiết bị cổng thông tin điện tử của cơ quan Thuế đảm bảo hệ thống hoạt động nhanh, ổn định; tiếp tục triển khai đến tất cả các địa phương đã có đầy đủ điều kiện cơ sở vật chất, hạ tầng về CNTT…