Doanh nghiệp nước ngoài, tổ chức nước ngoài sản xuất kinh doanh tại Việt Nam không theo Luật Đầu tư, Luật Doanh nghiệp hoặc có thu nhập phát sinh tại Việt Nam nộp thuế TNDN theo hướng dẫn riêng của Bộ Tài chính. Các doanh nghiệp này nếu có hoạt động chuyển nhượng vốn thì thực hiện nộp thuế TNDN theo hướng dẫn tại phần E của thông tư số 130/2008/TT-BTC
“… Trường hợp hợp đồng chuyển nhượng không quy định giá thanh toán hoặc cơ quan thuế có cơ sở để xác định giá thanh toán không phù hợp theo giá thị trường, cơ quan thuế có quyền kiểm tra vá ấn định giá chuyển nhượng. Căn cứ ấn định giá chuyển nhượng dựa vào tài liệu điều tra của cơ quan thuế hoặc căn cứ giá chuyển nhượng vốn của các trường hợp khác ở cùng thời gian, cùng tổ chức kinh tế hoặc các hợp đồng chuyển nhượng tương tự.”
Cũng tại Điểm 3 Phần E Thông tư số 130/2008/TT-BTC quy định về việc kê khai, nộp thuế với TNDN về nhượng vốn như sau:
Đối với doanh nghiệp Việt Nam và doanh nghiệp nước ngoài nhượng vốn, chuyển nhương chứng khoán. Doanh nghiệp có thu nhập từ chuyển nhượng vốn, chuyển nhượng chứng khoán thì khoản thu nhập này được xác định là khoản thu nhập khác và kê khai vào thu nhập chịu thuế khi tính thuế TNDN
Đối với doanh nghiệp nước ngoài, tổ chức nước ngoài sản xuất kinh doanh tại Việt Nam không theo Luật Đầu tư, Luật Doanh nghiệp chuyển nhượng vốn thì tổ chức, cá nhân chuyển nhượng vốn có trách nhiệm xác định, kê khai, khấu trừ thay tổ chức nước ngoài số thuế TNDN phải nộp.
…..
Địa điểm nộp hồ sơ khai thuế: Tại cơ quan thuế nơi doanh nghiệp, tổ chức, cá nhân nước ngoài chuyển nhượng vốn đăng ký nộp thuế.
Công văn số 1188/TCT-CS của Tổng cục Thuế ngày 11/04/2013 v/v xác định nghĩa vụ kê khai, nộp thuế (Download công văn)