Trong trường hợp chưa phát sinh nghĩa vụ nộp thuế giá trị gia tăng mới (vẫn còn âm thuế), doanh nghiệp bị phát hiện kê khai sai số thuế giá trị gia tăng chưa được khấu trừ do kê khai thiếu thuế giá trị gia tăng đầu ra, kê khai không đúng thuế giá trị gia tăng đầu vào sẽ chỉ bị xử phạt vi phạm thủ tục thuế.
Công văn 1275/TCT-TTr ngày 14/04/2011 của Tổng Cục thuế về trường hợp xử phạt đối với hành vi vi phạm thủ tục thuế (DownLoad Luật thuế)