Doanh nghiệp chậm nộp bản chính hóa đơn thương mại sau 30 ngày kể từ ngày đăng ký tờ khai hải quan sẽ không bị xử phạt hành chính nếu có lý do chính đáng. Tuy nhiên, nếu nộp sau thời hạn trên, doanh nghiệp sẽ bị xử phạt do chậm nộp hóa đơn đồng thời bị ấn định thuế và phải nộp số tiền thuế chênh lệch.
Công văn 1567/TCHQ-TXNK ngày 14/04/2011 của Tổng cục Hải quan về việc phạt chậm nộp bản chính hóa đơn thương mại (Download Luật)