Theo Công văn 4199 ngày 20/10/2010 của Tổng cục Thuế, khi giải thể, chi nhánh công ty có trách nhiệm hoàn thành các nghĩa vụ về thuế với Chi cục Thuế địa phương. Đối với số thuế giá trị gia tăng đầu vào chưa được khấu trừ hết hoặc nộp thừa của chi nhánh đã hoàn tất thủ tục giải thể, trụ sở chính sẽ được hoàn thuế.
Công văn 4199/TCT-DNL ngày 20/10/2010 của Tổng cục thuế về thuế giá trị gia tăng được khấu trừ của chi nhánh giải thể (Download Luật thuế).